MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 84118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008554	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747453
2	NC_008554	AAG	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747453
3	NC_008554	GA	3	6	500	505	50 %	0 %	50 %	0 %	116747453
4	NC_008554	CGAAG	2	10	510	519	40 %	0 %	40 %	20 %	116747453
5	NC_008554	CTG	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747453
6	NC_008554	CGG	2	6	705	710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747453
7	NC_008554	CAA	2	6	750	755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747453
8	NC_008554	CAG	2	6	757	762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747453
9	NC_008554	ACC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747453
10	NC_008554	GAT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747453
11	NC_008554	TTC	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747453
12	NC_008554	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747453
13	NC_008554	CTT	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747453
14	NC_008554	ATC	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747453
15	NC_008554	TGG	2	6	1298	1303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747453
16	NC_008554	CG	3	6	1353	1358	0 %	0 %	50 %	50 %	116747453
17	NC_008554	ATC	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747453
18	NC_008554	GGA	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747453
19	NC_008554	CG	3	6	1517	1522	0 %	0 %	50 %	50 %	116747453
20	NC_008554	GCC	2	6	1661	1666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747453
21	NC_008554	ACC	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747454
22	NC_008554	GATCG	2	10	2110	2119	20 %	20 %	40 %	20 %	116747454
23	NC_008554	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	116747454
24	NC_008554	TG	3	6	2301	2306	0 %	50 %	50 %	0 %	116747454
25	NC_008554	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747455
26	NC_008554	CCG	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747455
27	NC_008554	CAC	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747455
28	NC_008554	CAAG	2	8	3281	3288	50 %	0 %	25 %	25 %	116747455
29	NC_008554	CTT	2	6	3300	3305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747455
30	NC_008554	ACC	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747455
31	NC_008554	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	116747455
32	NC_008554	TTTG	2	8	3386	3393	0 %	75 %	25 %	0 %	116747455
33	NC_008554	TA	3	6	3433	3438	50 %	50 %	0 %	0 %	116747455
34	NC_008554	CGA	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747455
35	NC_008554	GTGA	2	8	3484	3491	25 %	25 %	50 %	0 %	116747455
36	NC_008554	TGGC	2	8	3994	4001	0 %	25 %	50 %	25 %	116747456
37	NC_008554	ATC	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747456
38	NC_008554	ACA	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747456
39	NC_008554	CAA	2	6	4042	4047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747456
40	NC_008554	CAC	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747456
41	NC_008554	CCT	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747456
42	NC_008554	GCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747456
43	NC_008554	CCT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747456
44	NC_008554	GAT	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747456
45	NC_008554	TAC	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747456
46	NC_008554	TCC	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747456
47	NC_008554	GAT	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747456
48	NC_008554	CGC	2	6	4608	4613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747456
49	NC_008554	CTG	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747456
50	NC_008554	CCG	2	6	4755	4760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747457
51	NC_008554	ATA	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116747457
52	NC_008554	GGC	2	6	4933	4938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747457
53	NC_008554	GGC	2	6	4948	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747457
54	NC_008554	GTT	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747457
55	NC_008554	AGC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
56	NC_008554	GAG	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
57	NC_008554	CCG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747457
58	NC_008554	CTC	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747457
59	NC_008554	GAA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
60	NC_008554	CGT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
61	NC_008554	GGA	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
62	NC_008554	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747457
63	NC_008554	GGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
64	NC_008554	GAT	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747457
65	NC_008554	GC	3	6	5562	5567	0 %	0 %	50 %	50 %	116747457
66	NC_008554	GAAC	2	8	5616	5623	50 %	0 %	25 %	25 %	116747457
67	NC_008554	AGA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
68	NC_008554	CGT	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
69	NC_008554	AGA	2	6	5889	5894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
70	NC_008554	GC	3	6	5906	5911	0 %	0 %	50 %	50 %	116747457
71	NC_008554	GCT	2	6	5916	5921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
72	NC_008554	AGC	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
73	NC_008554	ACC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747457
74	NC_008554	GAA	2	6	5968	5973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
75	NC_008554	GGGA	2	8	6031	6038	25 %	0 %	75 %	0 %	116747457
76	NC_008554	CAG	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
77	NC_008554	CAG	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
78	NC_008554	CGT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
79	NC_008554	GA	3	6	6209	6214	50 %	0 %	50 %	0 %	116747457
80	NC_008554	CGA	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
81	NC_008554	GCAC	2	8	6418	6425	25 %	0 %	25 %	50 %	116747457
82	NC_008554	GCC	2	6	6431	6436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747457
83	NC_008554	CAG	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
84	NC_008554	CGG	3	9	6456	6464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747457
85	NC_008554	GAG	2	6	6500	6505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
86	NC_008554	TGC	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
87	NC_008554	AGC	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
88	NC_008554	ATG	2	6	6539	6544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747457
89	NC_008554	GAA	2	6	6710	6715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747458
90	NC_008554	CCA	2	6	6740	6745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747458
91	NC_008554	CGA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
92	NC_008554	TCA	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747458
93	NC_008554	TCG	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
94	NC_008554	GCC	2	6	6982	6987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747458
95	NC_008554	GGC	2	6	6999	7004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747458
96	NC_008554	CGG	2	6	7010	7015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747458
97	NC_008554	TCG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
98	NC_008554	AGC	2	6	7129	7134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
99	NC_008554	GGT	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747458
100	NC_008554	CGA	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
101	NC_008554	GAT	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747458
102	NC_008554	GAT	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747458
103	NC_008554	TCG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
104	NC_008554	CGCA	2	8	7377	7384	25 %	0 %	25 %	50 %	116747458
105	NC_008554	CATG	2	8	7400	7407	25 %	25 %	25 %	25 %	116747458
106	NC_008554	ATGA	2	8	7419	7426	50 %	25 %	25 %	0 %	116747458
107	NC_008554	GGGC	2	8	7430	7437	0 %	0 %	75 %	25 %	116747458
108	NC_008554	TGC	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
109	NC_008554	CGA	2	6	7475	7480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
110	NC_008554	GAT	2	6	7506	7511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747458
111	NC_008554	GCC	2	6	7515	7520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747458
112	NC_008554	AGA	2	6	7573	7578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747458
113	NC_008554	GGC	2	6	7644	7649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747458
114	NC_008554	CCG	2	6	7685	7690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747458
115	NC_008554	CTC	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747458
116	NC_008554	C	7	7	7707	7713	0 %	0 %	0 %	100 %	116747458
117	NC_008554	GC	3	6	7721	7726	0 %	0 %	50 %	50 %	116747458
118	NC_008554	CTC	2	6	7803	7808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747459
119	NC_008554	AGGCA	2	10	7838	7847	40 %	0 %	40 %	20 %	116747459
120	NC_008554	GAT	2	6	7853	7858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
121	NC_008554	CAG	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747459
122	NC_008554	TGGC	2	8	7954	7961	0 %	25 %	50 %	25 %	116747459
123	NC_008554	GTC	2	6	8089	8094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
124	NC_008554	GAT	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
125	NC_008554	CCA	2	6	8117	8122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747459
126	NC_008554	AGC	2	6	8143	8148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747459
127	NC_008554	CTGG	2	8	8196	8203	0 %	25 %	50 %	25 %	116747459
128	NC_008554	ATC	2	6	8239	8244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747459
129	NC_008554	GGC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747459
130	NC_008554	CGG	2	6	8327	8332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747459
131	NC_008554	CTG	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
132	NC_008554	GAT	2	6	8502	8507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
133	NC_008554	C	6	6	8684	8689	0 %	0 %	0 %	100 %	116747459
134	NC_008554	GGC	2	6	8703	8708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747459
135	NC_008554	AGG	2	6	8749	8754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747459
136	NC_008554	GTA	2	6	8862	8867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
137	NC_008554	CGC	2	6	8870	8875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747459
138	NC_008554	GAG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747459
139	NC_008554	GTC	2	6	8923	8928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
140	NC_008554	CGT	2	6	8993	8998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
141	NC_008554	TGC	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
142	NC_008554	TTC	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747459
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147	NC_008554	GCTC	2	8	9435	9442	0 %	25 %	25 %	50 %	116747460
148	NC_008554	GTG	2	6	9476	9481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747460
149	NC_008554	TGT	2	6	9492	9497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747460
150	NC_008554	TCGT	2	8	9507	9514	0 %	50 %	25 %	25 %	116747460
151	NC_008554	ACC	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747460
152	NC_008554	ACG	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747460
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156	NC_008554	ATTTC	2	10	9867	9876	20 %	60 %	0 %	20 %	116747460
157	NC_008554	TGG	2	6	10005	10010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747460
158	NC_008554	GAATG	2	10	10048	10057	40 %	20 %	40 %	0 %	116747460
159	NC_008554	GC	3	6	10067	10072	0 %	0 %	50 %	50 %	116747460
160	NC_008554	TCA	2	6	10125	10130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747460
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163	NC_008554	GCC	2	6	10170	10175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747460
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165	NC_008554	CAC	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747460
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167	NC_008554	CAC	3	9	10462	10470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747460
168	NC_008554	GCC	2	6	10490	10495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747460
169	NC_008554	CGG	2	6	10497	10502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747460
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171	NC_008554	G	6	6	10662	10667	0 %	0 %	100 %	0 %	116747460
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176	NC_008554	TCCGA	2	10	10885	10894	20 %	20 %	20 %	40 %	116747460
177	NC_008554	AAT	2	6	10968	10973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116747460
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255	NC_008554	ATC	2	6	16136	16141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747463
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258	NC_008554	CGC	2	6	16314	16319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747463
259	NC_008554	CTC	2	6	16327	16332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747463
260	NC_008554	TCG	3	9	16394	16402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747463
261	NC_008554	CCT	2	6	16434	16439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747463
262	NC_008554	TGC	2	6	16505	16510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747463
263	NC_008554	ATC	2	6	16539	16544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747463
264	NC_008554	CAG	2	6	16561	16566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747463
265	NC_008554	G	6	6	16702	16707	0 %	0 %	100 %	0 %	116747463
266	NC_008554	CGG	2	6	16752	16757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747463
267	NC_008554	CTG	2	6	16822	16827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747463
268	NC_008554	GGA	2	6	16842	16847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747463
269	NC_008554	GCG	2	6	16872	16877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747463
270	NC_008554	GGA	2	6	16935	16940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747463
271	NC_008554	GGC	2	6	16975	16980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747463
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282	NC_008554	CTC	2	6	17494	17499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747463
283	NC_008554	GAG	2	6	17518	17523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747463
284	NC_008554	TCG	2	6	17538	17543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747463
285	NC_008554	CGG	2	6	17603	17608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747463
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289	NC_008554	CGT	2	6	17823	17828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747463
290	NC_008554	CTGCGC	2	12	18004	18015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116747463
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293	NC_008554	CCT	2	6	18228	18233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747463
294	NC_008554	CGGT	2	8	18268	18275	0 %	25 %	50 %	25 %	116747463
295	NC_008554	GC	3	6	18276	18281	0 %	0 %	50 %	50 %	116747463
296	NC_008554	CGC	2	6	18342	18347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747463
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